剑桥大学为书院联邦制大学，目前共有31所学院，而各个学术部门则被归入六个主要的学术学院里。
具体31个学院如下
基督学院（Christ‘s College，1505年建立）
丘吉尔学院（Churchill College，1960年建立）
卡莱尔学院（Clare College，1326年建立）
卡莱尔大厅学堂（Clare Hall，1965年建立）
圣体学院（Corpus Christi College，1352年建立）
达尔文学院（Darwin College，1964年建立）
唐宁学院（Downing College，1800年建立）
伊曼纽尔学院（Emmanuel College，1584年建立）
菲茨威廉学院（Fitzwilliam College，1966年建立）
格顿学院（Girton College，1869年建立）
冈维尔与凯斯学院（Gonville and Caius College，1348年）
哈默顿学院（Homerton College，1976年建立）
休斯学堂（Hughes Hall，1885年建立）
耶稣学院（Jesus College，1497年建立）
国王学院（King’s College，1441年建立）
露西·卡文迪什学院（Lucy Cavendish College，1965年）
麦格达伦学院（Magdalene College，1428年建立）
默里·爱德华兹学院（MurrayEdwardsCollege，原名新学堂 New Hall，1954年建立）
纽纳姆学院（Newnham College，1871年建立）
彭布罗克学院（Pembroke College，1347年建立）
彼得学院（Peterhouse，1284年建立）
女王学院（Queens‘ College，1448年建立）
罗宾森学院（Robinson College，1979年建立）
圣凯瑟琳学院（St Catharine’s College，1473年建立）
圣埃德蒙学院（St Edmund‘s College，1896年建立）
圣约翰学院（St John’s College，1511年建立）
塞尔文学院（Selwyn College，1882年建立）
西德尼·苏塞克斯学院（Sidney Sussex College，1596年建立）
三一学院（Trinity College，1546年建立）
三一学堂（Trinity Hall，1350年建立）
沃尔森学院（Wolfson College，1965年建立）
科系
据立思辰留学云介绍，剑桥大学现有超过150所科系和研究机构，科系的成员通常也是一所或多所学院的成员，通常负责大学的学术和研究工作。
大学的科系和研究机构被组合为六所主要的科系，每个主要科系由许多科系和研究机构组成，并拥有一个议会负责监督不同机构的教学和研究工作。剑桥大学六所主要的科系是：艺术和人文、生物科学（包括兽医医药）、临床医学、人文和社会科学、自然科学、技术。除此之外，剑桥大学的一些机构也负责大学的教学和研究，这包括剑桥大学考试委员会、剑桥大学出版社和大学图书馆。
