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2017-18年，牛津大学在泰晤士高等教育世界大学排名中位列世界第1、在USNews世界大学排名中位列世界第5、在QS世界大学排名中位列世界第6、在世界大学学术排名（ARWU）中位列世界第7。此外，在2018年《泰晤士高等教育》颁布的世界大学声誉排名中，牛津大学位列世界第5。
2018年12月18日，世界品牌实验室编制的《2018世界品牌500强》揭晓，牛津大学排名第99位。
牛津大学院系专业
牛津共有38个学院，它们和学校的关系就像美国中央政府与地方政府的关系那样采用联邦制形式。每一所学院都由Head of House和几个Fellows管理，他们都是各种学术领域的专家，其中大多数在学校都有职位。6个准学院（称为“永久性私人学堂”Permanent Private Halls、为各宗教教派所办），至今还保留着它们的宗教特许状。
此外还有一个继续教育学院。在35个学院中，众灵学院没有学生，只有院士（包括访问院士）。各学院规模不等，但都在500人以下，学生、教师（院士）来自不同的专业学科。
牛津的学院系统产生于大学诞生之时，并逐渐成为牛津市独立机构的集合体。
与大多数其他大学组织结构相似，牛津大学又根据专业分为不同的系。系通常在研究生教学中扮演主要角色，提供讲座、课程以及组织考试。系也通常是被外部机构包括大型研究委员会资助的研究中心。
除学院外，牛津大学的教学和研究活动（尤其是后者），主要由学部来组织，学部不是大学内的自治单位，它们都是跨学院的机构，不附属于任何一个学院，不过各学部的教师和学生，首先必须是牛津大学内某一学院的一员。
截至2017年5月，牛津大学现有4个学部：人文学部（Humanities）、社会科学部（Scocial Sciences）、数学物理和生命科学学部（Mathematical, Physical and Life Sciences）、医学科学学部（Medical Sciences），学部下设独立的中心和研究所等。
牛津大学学术研究
在生物医学领域，自从弗雷明在伦敦发现青霉素后。今天用得最广的抗生素，1955年为牛津的爱德华·阿布拉罕发现。牛津也致力于将分子生物学应用于临床，将核磁共振原理应用于 医疗诊断，在发现人体的免疫系统和应用基因工程技术于临床问题方面，牛津亦起领导作用。该校在艾滋病毒、移植手术和遗传病研究等方面也很有潜力。1987年斯奎波父子公司赠予该校药学系2，000万英镑，以支持他们的研究工作。
在环境科学领域，牛津的研究涉及森林史、气候变化、遥感、土地利用、野生动物保护、家畜管理、污染、腐蚀、沙漠侵犯等众多课题。
牛津的固体物理、高磁学、激光研究、基本粒子研究和大气物理学等均在世界上占领先地位。物理系的克拉伦登实验室在世界核研究领域中起着特殊的作用。基础研究还导向重要的工业开发，包括 建立了如牛津仪器公司和牛津激光公司之类的企业。
仅在化学系，牛津就拥有4位诺贝尔奖得主。该校 在蛋白质、新型无机材料合成、分子的计算机辅助设计等方面都有重大成果问世，并在化工、医药、微电子工业等领域推广应用。
