制药工程的研究方面主要包括药理学，药物分析，药剂学，药物化学等。其实在本科期间这些科目都是制药工程的主干课程，但是在研究生阶段就需要细分方向了，接下来介绍下相关的分支。
1. 药理学方向
这个专业主要是研究药物的作用机理及在体内的代谢。比如药物代谢动力学和药效学的研究。药理室新药研发的基础，也是新药上市申请的必要前提。所以就业相对而言比较容易，毕业生可以在各大制药公司的新药研发中心从事药理方面的相关研究。
2. 药物分析
主要研究药物成分的检测方法研究，毕业生可以在各大制药公司的食品药品检验疫所从事相应的药物检测工作。
3. 药剂方向
主要研究药物的处方与剂型，以适当的给药时间使药物在体内靶标释放和维持适当浓度，即通过优化药物时效来缓解病症。就业比较容易，毕业生可以在各大制药公司的新药研发中心从事剂型方面的相关研究。
4. 药物化学
主要研究药物的化学合成及其相关理化特征。它是新药特别是化学合成药研发和实现工业化生产的重要环节。就业比较容易，毕业生可以在各大制药公司的新药研发中心从新药合成方面的相关研究。
